Karel Pauzer se narodil 4. prosince 1936 v Praze. Od raného mládí ho zajímala příroda a během prázdninových pobytů na venkově kreslil a modeloval z hlíny. Ve dvanácti letech si vyzkoušel základní keramické techniky v dílně rodiny Davidových ve Štěchovicích a později si postavil vlastní keramickou pec.

V letech 1951-1955 studoval na Vyšší škole uměleckého průmyslu na Vinohradech a na Průmyslové škole bytové tvorby na Žižkově. Roku 1955 byl přijat na Vysokou školu uměleckoprůmyslovou v Praze, kde studoval stavební keramiku v sochařském ateliéru prof. Jana Kavana. Po ukončení školy v roce 1961 a absolvování vojenské služby se v letech 1966-1968 účastnil skupinových výstav mladých výtvarníků doma i v zahraničí.

Po roce 1970, kdy byl bez registrace v normalizačním Svazu výtvarných umělců, pracoval jako restaurátor při záchraně plastik v severočeské hnědouhelné pánvi. V osmdesátých letech se zúčastnil několika významných neoficiálních výstav a podílel se na sborníku „Šedá cihla“.

V roce 1987 se stal členem Nové skupiny výtvarníků a v roce 1990 obnovené Umělecké besedy. Karel Pauzer žije a pracuje v Brunšově.